En la temporada 2024-25, el Betis juvenil debutó en la Youth League, cayendo en dieciseisavos de final tras perder 0-1 contra el Bayern en su campo, la ciudad deportiva Luis del Sol.

Durante la 2025-26, el equipo mostró un gran rendimiento al alcanzar los octavos de final, superando a rivales de renombre como Basilea, Oporto y Tottenham. Sin embargo, en la ronda de los dieciseisavos, se enfrentó al Inter en Milán, donde sufrió una dura derrota por 5-3, evidenciando la falta de su estrella Manu González.

En la actual campaña, el Betis juvenil se coronó campeón de la Copa del Rey tras una espectacular victoria sobre el Barcelona en la final. A pesar de este éxito, no logró clasificar para la Copa de Campeones, finalizando segundo en el Grupo 4, detrás del Granada, en una emocionante última jornada donde el primer puesto se decidió por muy poco.

Entre los jugadores que han destacado en el Betis juvenil se encuentran Jesús Rodríguez, Yanis, Dani Pérez, Pablo García, Ortiz, Corralejo, Manu González, Morante, Masqué, Marina, De Roa, Romero, Rica, Curro, y Emmanuel, quienes han ido ganando protagonismo tanto en el Betis Deportivo como en el primer equipo.